Das Kirchengebäude spielt mit seinem basilikalen Querschnitt und dem Mosaik auf den konstantinischen Bau und das Atrium von Alt-St.-Peter an, den Bau, der bereits ab 1506 dem heute sichtbaren Neubau weichen musste. Durch die zum Heiligen Jahr 1500 geöffnete Heilige Pforte wird die Heilige Säule sichtbar, die der Legende nach vom Tempel Salomons stammt (heute: Museum von St. Peter). Der Schlüssel des Petrus und das lateinische Spruchband ("Kraft meines apostolischen Amtes vergebe ich euch alle Sünden") verweisen auf die Grundlagen des Ablasswesens, die Binde und Lösegewalt des Papstes. Zum Heiligen Jahr wurde stets der vollkommene Ablass (Nachlass der zeitlichen Sündenstrafe, die nicht durch die Beichte getilgt wird) erteilt, der Ablass wurde im Dezember 1501 durch den Kardinallegaten Raimund Peraudi von Rom auf Augsburg übertragen.